DETEKSI POLYMORPHISME DENGAN SUBSTITUSI NUKLEOTIDA TUNGGAL PADA Streptococcus agalactiae ISOLAT LOKAL INDONESIA

Search by :

ALL Author Subject ISBN/ISSN Advanced Search

Last search:

PDF

DETEKSI POLYMORPHISME DENGAN SUBSTITUSI NUKLEOTIDA TUNGGAL PADA Streptococcus agalactiae ISOLAT LOKAL INDONESIA

Helga Seege - Personal Name; Indonesia. KKP. Badan Penelitian dan Pengembangan Kelautan dan Perikanan - Organizational Body; Angela Mariana Lusiastut - Personal Name; Hessy Novita - Personal Name; Tatik Mufidah - Personal Name; Desy Sugiani - Personal Name;

Kasus penyakit pada budidaya ikan nila di wilayah di Jawa Barat, Jawa Tengah, Jawa Timur, Sulawesi Utara dan Papua Barat, disebabkan Streptococcus yang menyebabkan penyakit Streptococcosis di mana 80% disebabkan oleh grup B S. agalactiae. Tujuan penelitian ini adalah melakukan deteksi pada nukleotida isolat S. agalactiae untuk mengetahui sampai sejauh mana terjadinya nukleotida polimorfisme tunggal (SNP) pada isolat tersebut. Identifikasi menggunakan PCR dilakukan terhadap 16S rDNA dan primer spesifik spesies terhadap S. agalactiae yaitu agal I 5’-ATAAGAGTAATTAACACATGTTAG-3’ (forward) dan agal II 5’-ACTTCGGGTGTTACAAAC-3’(reverse) dengan target 1250 bp. Produk PCR diamplifikasi terlebih dahulu menggunakan tujuh pasangan primer oligonukleotida yang berbeda yang didesain dari sekuens genom NEM316 GBS. Sekuens yang diperoleh dibandingkan dengan sekuens di Gene Bank database menggunakan National Center for Biotechnology Information Blast search tool. Hasil yang diperoleh ternyata ada dua basa yang berubah yaitu pada basa 24 dan basa 167. Pada basa 24 jelas terjadi subtitusi basa baru yaitu G, yang seharusnya tidak ada basa tersebut pada gen adhP-54 dan adhP-49 standar. Sedangkan pada basa 167 terjadi perbedaan basa dari seharusnya A pada standar menjadi G pada isolat 2.

Availability

B1801674 Koleksi Digital Archivelago Indonesia Marine Library - Perpustakaan Kementerian Kelautan dan Perikanan Available

Detail Information

Series Title: -
Call Number: Koleksi Digital
Publisher: 2015 : KKP-Balitbang., Jakarta
Collation: 8 hlm
Language: Indonesia
ISBN/ISSN: -
Classification: NONE
Content Type: -
Media Type: -
Carrier Type: -
Edition: Volume 10 No 2 Tahun 2015
Subject(s): Local Content
Publikasi Internal
streptococcus agalactiae
Karya Ilmiah
Artikel Ilmiah
polimorfisme
Specific Detail Info: -
Statement of Responsibility: -

DETEKSI POLYMORPHISME DENGAN SUBSTITUSI NUKLEOTIDA TUNGGAL PADA Streptococcus agalactiae ISOLAT LOKAL INDONESIA

Availability

Detail Information

Other version/related

File Attachment

Comments