Archivelago Indonesia Marine Library

Perpustakaan Kementerian Kelautan dan Perikanan Republik Indonesia

  • Home
  • News
  • Librarian
  • Koleksi Digital
    eBook dan Teks eBook
  • Select Language :
    Arabic Bengali Brazilian Portuguese English Espanol German Indonesian Japanese Malay Persian Russian Thai Turkish Urdu

Search by :

ALL Author Subject ISBN/ISSN Advanced Search

Last search:

{{tmpObj[k].text}}
No image available for this title

PDF

Transposon Insertion Phenomenon during Cloning of a Partial Fragment Derived from Metagenomic DNA Isolated from Deep-Sea Water and Sediment of Kawio Island, North Sulawesi

Indonesia. KKP. Badan Riset dan Sumber Daya Manusia Kelautan dan Perikanan - Personal Name; Mochamad Untung Kurnia Agung - Personal Name; Maelita Ramdani Moeis - Personal Name;

Transposon yang dikenal sebagai mobile element ditemukan melimpah pada genom prokariot maupun eukariot. Pada bakteri, transposon dapat berpindah dari kromosom ke dalam plasmid dan atau sebaliknya. Salah satu jenis transposon yang ditemukan pada bakteri yang dikenal sebagai insertion sequence (IS), diketahui tidak mengkode gen tambahan lain kecuali gen pengkode transposase, yaitu enzim yang berperan pada aktivitas transposisi dari suatu transposon. Penemuan fenomena aktivitas insersi (transposisi) dari suatu transposon secara tidak sengaja ditemukan pada saat proses kloning suatu fragmen parsial yang berasal dari DNA metagenom laut¬dalam pada penelitian ini. Pada mulanya, penelitian ini bertujuan untuk mengklon dan mengkarakterisasi gen pengkode a¬amilase yang ditapis dari DNA metagenom yang diisolasi dari air dan sedimen laut¬dalam perairan Pulau Kawio, Sulawesi Utara. DNA metagenom berhasil diisolasi dari sampel air dan sedimen laut¬dalam dan dengan menggunakan teknik Whole Genome Amplification (W GA) berhasil ditingkatkan kuantitasnya hingga mencapai 146,31 ng untuk setiap 1 ng DNA metagenom. Suatu fragmen parsial berukuran ~1000 pb berhasil diisolasi dengan menggunakan metode
touchdown PCR. Fenomena kehadiran transposon dalam fragmen parsial tersebut terungkap pada saat proses kloning di mana terjadi perubahan ukuran fragmen menjadi hanya 310 pb pada akhir tahapan kloning. Analisis hasil sekuensing menunjukkan kemiripan tertinggi fragmen tersebut dengan gen pengkode replication protein (Rep) dari bakteri Pseudomonas putida (Query Coverage: 88%; Max. Identity: 80%, Positive: 86%) dan protein ini diketahui terlibat pada proses replikasi plasmid di mana gen pengkode transposase juga diketahui hadir bersama gen ini (gen Rep) pada plasmid suatu bakteri.


Availability
B1801277Koleksi DigitalArchivelago Indonesia Marine Library - Perpustakaan Kementerian Kelautan dan PerikananAvailable
Detail Information
Series Title
-
Call Number
Koleksi Digital
Publisher
2013 : KKP-BRSDM., Jakarta
Collation
-
Language
English
ISBN/ISSN
-
Classification
NONE
Content Type
-
Media Type
-
Carrier Type
-
Edition
-
Subject(s)
Local Content
Publikasi Internal
Karya Ilmiah
Deep Sea Water
Artikel Ilmiah
Transposon
Metagenomic
partial fragment
Cloning
Specific Detail Info
-
Statement of Responsibility
-
Other version/related

No other version available

File Attachment
  • Please login to see this attachment
Comments

You must be logged in to post a comment

Archivelago Indonesia Marine Library
  • Information
  • Services
  • Librarian
  • Member Area
  • Katalog Integrasi
  • Pengajuan Penerbitan ISBN

About Us

Archivelago Indonesia Marine Library yang berasal dari gabungan kata ‘archive’ dan ‘archipelago’ yang memiliki makna tempat yang paling sesuai dan lengkap untuk menyimpan informasi mengenai kelautan dan perikanan Indonesia, merupakan perpustakaan khusus di bawah Sekretariat Jenderal Kementerian Kelautan dan Perikanan, dengan koleksi khusus di bidang kelautan dan perikanan.

Search

start it by typing one or more keywords for title, author or subject

Keep SLiMS Alive Want to Contribute?

© 2023 — Senayan Developer Community

Powered by SLiMS
Chat With Librarian

Please type your name before starting in conversations.


You may also hit Enter button to starting in conversation.
Select the topic you are interested in
  • Perikanan Tangkap
  • Perikanan Budidaya
  • Pengolahan Ikan
  • Pulau Kecil
  • Masyarakat Pesisir
  • Local Content
  • Ekspor Perikanan
  • Illegal Fishing
  • Ilmu - Ilmu Sosial
  • Geografi dan Sejarah
Icons made by Biro Humas dan KLN Kementerian Kelautan dan Perikanan from www.kkp.go.id
Advanced Search